¿Cómo recuerda esas semanas previas al estado de alarma hace ya casi un año? ¿Cómo lo vivieron en el servicio?
En la segunda quincena de enero de 2020 solicitamos los primeros reactivos de PCR para COVID-19 a Roche, que los empezaba a distribuir a todos los laboratorios de Microbiología. Era una PCR manual y laboriosa y la única con la que se podía contar en ese momento. Hay que recordar que se había secuenciado el virus, que todavía no se había denominado SARS-CoV-2, y compartido esa secuencia el 10 de enero, para que se pudieran fabricar las primeras PCR de uso comercial, aunque en fase de autorización por el procedimiento de urgencia. Así pudimos descartar el primero caso sospechoso el 31 de enero, en una ciudadana china que volvió a Vitoria-Gasteiz desde China después de pasar la celebración del año nuevo chino. Fue negativa pero se confirmó que tenía gripe B. A lo largo de febrero optimizamos la PCR de Roche y se adquirieron más reactivos de extracción de ARN.
¿Cómo adaptaron la organización del servicio ante la avalancha de casos durante los meses de marzo y abril? ¿Estaban preparados los servicios de microbiología de la sanidad vasca para una situación así?
A finales de febrero de 2020 ya se detectaron las primeras PCR positivas, se empezó con las guardias localizadas de Microbiología y se reforzó la plantilla de técnicos de laboratorio asignados a este laboratorio. Obviamente la avalancha de pacientes que entraban por urgencias, a veces previo paso a UCI con neumonías bilaterales, hizo angustiosa la escasez de reactivos para las PCR y de fungibles como las puntas de pipeta de plástico. A lo largo de marzo y abril hubo roturas de stock continuas en reactivos y fungibles que nos sumieron en la ansiedad, y fue paliada en parte por la labor abnegada del personal facultativo y técnico de Microbiología, que vivió casi en el laboratorio, y por otra parte, por el compartir con el resto de servicios de Microbiología de la CAPV los escasos reactivos y material de laboratorio del que disponíamos.
¿Cómo fue evolucionado la situación del servicio de Microbiología hasta la situación actual?
A partir de mayo-junio del 2020, las diferentes firmas comerciales de Microbiología molecular fueron produciendo más reactivos y se contó cada vez más con los fungibles necesarios pero imprescindibles para que se pudieran obtener los resultados de las PCR en un tiempo de respuesta al clínico en < 24 horas. Antes del verano ya se contaba con reactivos para la detección de anticuerpos de forma automatizada por quimioluminiscencia, que sustituían a los primeros reactivos manuales y de rendimiento diagnóstico limitado. Después del verano ya se dispuso de reactivos manuales de detección de antígenos, que eran dispositivos que permitían la detección in situ en el ámbito de la solicitud (atención primaria, urgencias, etc.)
Hoy en día disponemos de equipos y reactivos diferentes para que la demanda de pruebas de PCR, antígenos y serología para detección de anticuerpos esté asegurada.
La plantilla de microbiólogos (en número de 9) y de técnicos de laboratorio (en número de 48) atiende no sólo la demanda de pruebas para descartar COVID-19 sino toda la detección de microorganismos de los diferentes síndromes infecciosos y su correspondiente sensibilidad a los antimicrobianos.
¿Hay motivo de alarma por las nuevas cepas detectadas?
Los virus viven mutando y el SARS-CoV-2 no es una excepción. Ya se detectó una primera variante durante el verano, que afectó a los temporeros que recogían fruta en Huesca y Lérida, que se hizo preponderante y se extendió por Europa.
La secuenciación genómica es una técnica que se debe implantar en todos los laboratorios de microbiología y no sólo para detectar las variantes del SARS-CoV-2, sino para realizar el tipado molecular de los microorganismos multirresistentes de interés para Salud Pública. Hay que recordar que el laboratorio de Microbiología del Hospital Universitario Araba es un laboratorio declarado de nivel 2 en 2019 por el Plan Nacional de Resistencia a los Antimicrobianos (PRAN), que a su vez es trasposición del mandato de la Comisión Europea, con unos objetivos para 2020 de tipado molecular para bacterias de especial interés, como las enterobacterias productoras de carbapenemasa, S. aureus resistente a meticilina y las cepas toxigénicas de Clostridiodes difficile. Estos objetivos se han ralentizado por la pandemia de 2020, pero progresivamente va a haber que cumplirlos.
Hasta ahora sólo se realizaba secuenciación genómica en el seno de proyectos de investigación con los equipos disponibles en la UPV/EHU o en los Institutos de Investigación Sanitaria. Lógicamente la demanda va a facilitar el abaratamiento de costes de este equipamiento y de sus reactivos, lo que va a posibilitar que esté implementada esta tecnología en la mayor parte de hospitales de la red de Osakidetza.
Atendiendo a la secuenciación de genomas del SARS-Cov-2, hacia donde se dirige la mutación de virus ¿se debilita o se hace más virulento?
De momento se sabe que las nuevas variantes lo hacen más fácilmente transmisible. No cambia las medidas preventivas recomendadas para evitar en la medida de lo posible la transmisión.
¿Están sirviendo los estudios de seroprevalencia? ¿Y el análisis en aguas residuales?
El análisis de aguas residuales es útil en cuanto anticipa el nivel de exposición de la población objeto de estudio. Los estudios de seroprevalencia es una de las indicaciones que le van quedando a la detección de anticuerpos, ya que son poco útiles para el diagnóstico de la infección aguda. Su nicho actual es el diagnóstico de la infección pasada y quizá en el seguimiento de las personas vacunadas, aunque aún es prematuro precisar en este punto concreto.
En este inicio del proceso de vacunación, se van autorizando de forma progresiva distintas vacunas para suministrar a la población.
Todas las vacunas autorizadas para su comercialización por las agencias reguladoras son seguras. Hay que seguir chequeando las variantes del virus para comprobar cómo afectan a la eficacia de las diferentes vacunas. Hay que recordar que debido a los fenómenos de recombinación genética del virus de la gripe, todos los años hay que fabricar vacunas distintas frente a los virus de la gripe circulantes.
¿En qué medida es positivo que haya vacunas de diferentes tipos, con mayor o menor efectividad en función de la población diana a la que van dirigidas?
Es una situación que es común en el campo de las enfermedades infecciosas. Por poner un ejemplo, hay diferentes tipos de vacunas frente al neumococo, en cuanto a composición de serotipos (polisacárido capsular de 23 serotipos VPN23, conjugada de 13 serotipos VCN13), población diana a proteger (adultos > 65 años, niños < 5 años), pautas posológicas distintas a intervalos diferentes, etc. En cuanto a la prevención de COVID-19 deben seguirse las recomendaciones de las agencias reguladoras y de las comisiones técnicas de vacunas.
¿Entiende las dudas o reticencias existentes en algunos sectores sobre la vacuna a la hora de inmunizarse?
Como médico y microbiólogo no las entiendo. Pero la vacunación ha salvado miles de vidas y erradicado enfermedades como la viruela (1977). Las vacunas de ARNm (ARN mensajero monocatenario) son seguras y razonablemente bien toleradas, y llevan probándose en ensayos preclínicos y clínicos para otras entidades infecciosas y no infecciosas desde hace años.
No es el primer coronavirus que irrumpe en nuestras vidas, aunque este es el primero que se convierte en pandémico. ¿Tendremos que acostumbrarnos a vivir con próximas pandemias?
Este es el tercer coronavirus (SARS-CoV-2) en producir brotes en humanos. Los dos anteriores, el del SARS-CoV en China en 2003 y el del MERS-CoV en Arabia Saudí en 2012, produjeron brotes con una elevada mortalidad (10% y 30%, respectivamente). Son zoonosis que saltan desde otros mamíferos como los murciélagos y en un mundo globalizado sin fronteras resalta la importancia del concepto de salud global (One Health) y de la medicina veterinaria.
¿La situación actual ha permitido poner en valor valorar la figura del microbiólogo?
Eso queremos creer los propios microbiólogos, aunque a la vista de lo ocurrido en esta pandemia, donde han salido virólogos y epidemiólogos aficionados de debajo de las piedras, meros “retuiteros” de opiniones ajenas a veces sin contrastar, no estamos nada seguros de que vaya a ser así. De todas formas, el prestigio científico y el buen hacer de la Microbiología española desde hace años en los laboratorios de Microbiología de los hospitales públicos está fuera de toda duda. Es uno de los países europeos con mayor producción científica en revistas de impacto y en participación en el congreso europeo de la especialidad (ECCMID).
Otra cosa muy distinta es nuestra proyección dentro de los organigramas de las organizaciones de servicios. Con frecuencia se confunde el sitio donde trabajamos, el laboratorio, con la especialidad. Y hay que recordar que en los laboratorios de los hospitales públicos trabajamos, cada uno en el ámbito que le corresponde, varias especialidades, como son los profesionales de bioquímica/análisis clínicos, hematología, inmunología, genética y microbiología, entre otros. Por lo tanto, si estamos ante una situación provocada por una enfermedad infecciosa en la que hay que utilizar pruebas microbiológicas para su diagnóstico, lo lógico es que los microbiólogos tengamos mucho que decir y aportar, lo que con frecuencia no hemos visto refrendado por la opinión pública y los medios y redes sociales.
“Las vacunas de ARNm son seguras y razonablemente bien toleradas, y llevan probándose en ensayos preclínicos y clínicos para otras entidades infecciosas y no infecciosas desde hace años. La vacunación ha salvado miles de vidas y erradicado enfermedades como la viruela.”
